Variante BA.2

En primer lugar, ¿qué es BA.2? BA.2 es un linaje hermano de BA.1. Actualmente, ambos linajes se definen como la variante ómicron. BA.2 comparte muchas mutaciones con BA.1, pero también tiene muchas diferencias.

BA.2 comparte 32 mutaciones con BA.1, pero también tiene 28 (!) mutaciones únicas. 28, eso es mucho. Es más que la definición en α, β, γ y la mayoría de los clados principales de δ.

Tomando las mutaciones definitorias de BA.1 y BA.2 (solo NS) y comparando el parecido entre las 2 variantes en las partes principales del genoma. Algunas diferencias en S1. E es el mismo, N & M son diferentes en 1 mutación entre las dos variantes; y una gran diferencia cuando vamos a ORF1ab.

BA.2 también carece de las mutaciones Δ69-70 en la espícula, lo que significa que no causa fallas en el objetivo del gen S en el ensayo taqman qPCR. Este ensayo se utilizó al principio de la ola de ómicron para estimar la rapidez con la que se propagó BA.1. Esta es la razón por la que BA.2 se describió erróneamente como una "variante sigilosa" desde el principio.

¿Qué está haciendo BA.2 actualmente? BA.2 parece ser el principal linaje ómicron en (parte de) India y Filipinas y hay evidencia de que está creciendo en comparación con BA.1 en Dinamarca, el Reino Unido y Alemania. Puede revisar la gráfica interactiva desarrollada por Project Jupyter para ver los países/linajes.

En la mayoría de los demás países, BA.1 sigue siendo dominante, aunque BA.2 parece crecer lentamente en participación en todas partes. Aparte de algunas predicciones basadas en la secuencia BA.2 de Bloom Lab no se sabe mucho sobre BA.2. Los primeros datos clínicos posiblemente provendrán de Dinamarca.

El crecimiento constante en varios países es evidencia de que BA.2 puede ser un poco más transmisible que BA.1. Esta es la razón principal por la que BA.2 está actualmente en las noticias.

Desafortunadamente, aquí es realmente donde termina la evidencia en su mayoría: actualmente no tenemos un control sólido sobre la antigenicidad, la gravedad o mucha evidencia de cuánta más transmisibilidad podría tener BA.2 sobre BA.1; sin embargo, podemos hacer algunas conjeturas/observaciones tempranas.

Las primeras observaciones de India y Dinamarca sugieren que no hay una diferencia dramática en la gravedad en comparación con BA.1. Estos datos deberían volverse más sólidos (de una forma u otra) en las próximas semanas.

Algunas predicciones de Bloom Lab sugieren que es probable que las mutaciones en la espícula del dominio de unión al receptor tengan un impacto bastante mínimo en la antigenicidad en comparación con BA.1.

También es probable que haya diferencias mínimas en la efectividad de la vacuna contra BA.1 y BA.2 y, también es muy probable que la infección BA.1 proporcione una reactividad cruzada decente contra la infección BA.2.

Entonces, ¿qué tan preocupados deberíamos estar? Aquellos que trabajan en secuenciación/vigilancia definitivamente deberían estar atentos a BA.2 (¡y es muy probable que ya lo estén!). Personalmente, no estoy seguro de que BA.2 vaya a tener un impacto sustancial en la ola actual de la pandemia de ómicron.

Varios países están cerca, o incluso más allá del pico de las ondas BA.1. Me sorprendería mucho si BA.2 causara una segunda ola en este punto. Incluso con una transmisibilidad ligeramente mayor, esto no es absolutamente un cambio delta -> ómicron y, en cambio, es probable que sea más lento y sutil.

Casi toda la literatura sobre ómicron se realiza utilizando BA.1. Los laboratorios de virología de todo el mundo están luchando para evaluar BA.2 (y ver si hace lo mismo que BA.1). Sospecho que los datos de laboratorio comenzarán a aparecer en las próximas dos semanas.