Variante EG.5.1

La variante XBB.1.9.2.5.1, mejor conocida como EG.5.1 o Eris, es una variante descendiente de XBB.1.9.2 con mutaciones F456L y Q52H [1]. La primera muestra de EG.5.1 se registró en Yakarta, Indonesia, a mediados de marzo de 2023. Desde allí, se extendió con bastante rapidez al norte de Asia y Europa central, luego a través de América del Norte y alrededor del mundo [2].



El 4 de agosto de 2023, los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC, por sus siglas en inglés) en su informe quincenal de vigilancia genómica reportó un aumento continuo de la variante EG.5.1, que casi se duplicó en las últimas dos semanas, lo que demuestra una ventaja de crecimiento significativa en comparación con sus precursores de variantes XBB predominantes (e.g., XBB.1.5; XBB.1.16; XBB.1.9) [3].



El auge de EG.5.1 no se limita en absoluto a los Estados Unidos. Es notable en todo el Reino Unido [4], Europa y Asia. Los gráficos a continuación, publicados por Mike Honey, muestran bien su despegue [2].



De hecho, la proporción de nuevas secuencias con la mutación clave en la proteína de la espícula que se observa en EG.5* (y FL.5.1), F456L, supera el 35 % en todo el mundo.


La variante EG.5.1 fue perfilada en el laboratorio dirigido por el Profesor Asistente Yunlong Cao (PhD en Química) de la Universidad de Pekín. Este laboratorio ha estado al frente durante la pandemia para evaluar con precisión y rapidez nuevas variantes y su significado funcional. Esta variante con F456L es muy probablemente una consecuencia de mutaciones de escape del amplio uso de anticuerpos monoclonales y se predijo que ocurrirían hace muchos meses.


El impacto de EG.5.1 para los anticuerpos neutralizantes se ve a continuación para personas con infecciones BA.5 y XBB (1.5 o 1.16). Puede ver la caída de los niveles de anticuerpos neutralizantes (Plasma NT50) cuando se agrega la mutación F456L a XBB.1.5 y para EG.5.1 que porta esta mutación. Por lo tanto, la variante EG.5.1 plantea un desafío para nuestra respuesta inmunitaria humoral (de anticuerpos) [5].



La próxima mutación combo FLip

Hay 2 mutaciones adyacentes en las posiciones de la proteína de la espícula 455 y 456 que muestran que el virus ha aprendido un nuevo truco. Se llama FLip porque ambas mutaciones están entre F y L: una L a F, la otra F a L. Juntos, pero no solos, la proteína de la espícula se une más ávidamente a la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2, por sus siglas en inglés), el receptor celular del virus [5].



Y, como se ve arriba en el gráfico de anticuerpos neutralizantes, esta mutación combo FLip también conduce a una mayor reducción de anticuerpos neutralizantes. Esto ciertamente sugiere que esta evolución del virus será más preocupante que EG.5.1 y podemos esperar que muestre una mayor ventaja de crecimiento en las próximas semanas.


Actualmente, se encuentra en niveles bajos a nivel mundial (~2%), pero hay lugares donde la FLip está despegando, como Brasil y España, como se muestra a continuación en el gráfico de Mike Honey [2].



La gran pregunta es: ¿estamos listos para EG.5.1? ¿FLip? Realmente, no sabemos. Para ser claros, no estamos viendo un "evento ómicron" ahora, en el que habrá un aumento dramático en la transmisión y resultados adversos debido a una gran cantidad de nuevas mutaciones. Pero estos cambios en la proteína de la espícula del virus (y otros componentes que no se revisan aquí, como ORF1a, ORF1b, la nucleocápside, etc.) son una señal de que hay más por venir con el SARS-CoV-2 y tenemos un mal historial de estar siempre rezagados.


Referencias

[1] https://twitter.com/EllingUlrich/status/1687798369001807872

[2] https://github.com/Mike-Honey/covid-19-genomes

[3] https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions

[4] https://www.gov.uk/government/publications/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate-update-2-august-2023

[5] https://twitter.com/yunlong_cao/status/1687879512237993986

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