Variante BA.5
El sub-linaje ómicron/BA.5 es la peor versión del SARS-CoV-2. Lleva el escape inmunológico, ya extenso, al siguiente nivel y, en función de eso, mejora la transmisibilidad, mucho más allá de ómicron/BA.1 y otros sub-linajes de la familia ómicron que hemos visto (incluyendo BA.1.1, BA.2, BA.2.12.1 y BA.4). Se podría decir que no es tan malo porque no ha habido un marcado aumento en las hospitalizaciones y muertes como vimos con ómicron/BA.1, pero eso es solo porque tuvimos un impacto adverso tan sorprendente de ómicron, para el cual existe al menos algo de inmunidad cruzada (BA.1 a BA.5).
La biología de BA.5
Hay muchas maneras de tener una idea de cuán diferente es BA.5 en comparación con las variantes anteriores y la familia ómicron. Está su distancia genética: cómo su secuencia se transformó con el tiempo, lo que indica que BA.4 y BA.5 son derivados de BA.2, en diferentes extremidades de BA.1.
Luego está el mapa antigénico, que nos informa sobre la proteína de la espícula del virus y cómo la "ve" nuestro sistema inmunológico. BA.4, que tiene una secuencia de proteína de la espícula muy similar a BA.5 (vide infra), no ha sido mapeada por este post, pero teóricamente estarían fuera del gráfico. Puede ver que la distancia antigénica de BA.1 a BA.2 es mucho mayor que la cepa original a delta o beta o gamma. Esta es la base del escape inmunitario de BA.5: nuestro reconocimiento y respuesta relativamente deficientes a la proteína de la espícula.
Tuekprakhon y colaboradores [1] mapearon antigénicamente BA.4 y BA.5 y aquí hay múltiples vistas para mostrar qué tan lejos están de las variantes anteriores.
Una característica importante de este sub-linaje es su aptitud, que es la combinación del crecimiento del linaje, el número básico de reproducción, el grado de evasión inmune y el tiempo de generación. A partir de un análisis de 6.4 millones de secuencias de SARS-CoV-2, aquí está el gráfico de aptitud, y tengan en cuenta que BA.2 está en la parte superior derecha, mientras que BA.5 estaría bien fuera de la tabla de aptitud máxima.
Sobre el tema de la aptitud, cabe destacar la ventaja de crecimiento de BA.5 en relación con BA.2 y BA.2.12.1, según lo analizado recientemente por UKHSA [2].
En resumen, BA.5 es bastante distinta y muy en forma, lo que representa una marcada diferencia con todas las variantes anteriores, pero ¿cómo se logró esto? Existen diferencias importantes en la secuencia de la espícula, pero las mutaciones BA.5 se extienden más allá de eso a otras partes del virus, como se muestra a continuación, en comparación con los principales sub-linajes de ómicron, incluida la forma en que difiere de BA.4, principalmente fuera de la proteína de la espícula (S).
Dado que básicamente nos centramos en las espículas, lo que descarta el potencial de las mutaciones que no son espículas (que probablemente sean importantes para comprender BA.4 frente a BA.5), estas son las diferencias de secuencia clave en comparación con BA.2 y los otras sub-linajes de ómicron.
Con esos antecedentes, nos dirigimos a la respuesta inmunitaria y notamos consistentemente de los sueros de los pacientes que BA.4 y BA.5 son los sub-linajes más inmuno evasivas con niveles bajos de respuestas de anticuerpos neutralizantes observados en múltiples estudios hasta la fecha [3].
Por supuesto, surge la pregunta de si BA.5 es más virulenta o patógena, capaz de inducir una enfermedad peor. Hasta el momento, solo tenemos un estudio experimental sobre eso y se demostró que BA.4 y BA.5 indujeron una peor enfermedad en el modelo de hámster sirio y se propagaron de manera más eficiente en cultivos de células pulmonares [4].
¿Las vacunas actuales funcionan contra BA.5? El nuevo informe de UKHSA [2] comenzó a abordar esta pregunta, analizando las infecciones sintomáticas y las enfermedades severas, pero no está claro. Con el alcance de la evasión inmunitaria de BA.5 y las tendencias recientes de menor efectividad de la vacuna frente a enfermedades severas (del 95% frente a delta con un refuerzo a ~80% frente a ómicron/BA.1 o BA.2 con un refuerzo), no me sorprendería en absoluto ver una mayor disminución de la protección contra hospitalizaciones y muertes.
La gran pregunta ahora es si una dosis de refuerzo, con una vacuna dirigida a ómicron/BA.1, ayudará cuando ese sub-linaje ya no esté con nosotros, y estaremos cerca del 100% de BA.5 en cuestión de semanas. Y sin duda habrá más variantes/sub-linajes problemáticas que se avecinan, ya sea más en la familia ómicron o en un linaje completamente nuevo.
Referencias
[1] Tuekprakhon, A., Huo, J., Nutalai, R., Dijokaite-Guraliuc, A., Zhou, D., Ginn, H.M., ... & Screaton, G.R. (2022). Antibody escape of SARS-CoV-2 omicron BA. 4 and BA. 5 from vaccine and BA. 1 serum. Cell. doi: 10.1016/j.cell.2022.06.005
[3] Quandt, J., Muik, A., Salisch, N., Lui, B. G., Lutz, S., Krüger, K., ... & Sahin, U. (2022). Omicron BA.1 breakthrough infection drives cross-variant neutralization and memory B cell formation against conserved epitopes. Science Immunology, eabq2427. doi: 10.1126/sciimmunol.abq2427
[4] Kimura, I., Yamasoba, D., Tamura, T., Nao, N., Oda, Y., Mitoma, S., ... & Sato, K. (2022). Virological characteristics of the novel SARS-CoV-2 omicron variants including BA.2.12. 1, BA.4 and BA.5. bioRxiv. doi:
This article is a preprint and has not been peer-reviewed.
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